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        廣西研究團(tuán)隊(duì)破解葡萄霜霉菌全基因組遺傳密碼

        2017-04-20 11:03:37 來(lái)源:南寧晚報(bào)
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        摘要

        該研究成果涉及多個(gè)生物信息學(xué)分析工作,為防治葡萄霜霉病提供了新的理論基礎(chǔ),也為葡萄霜霉病的綜合防控提供新的研究方向和策略。

        來(lái)源

        南寧晚報(bào)
        鐘漢龍

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        葡萄霜霉病是一種全球性且嚴(yán)重影響葡萄產(chǎn)量和品質(zhì)的葡萄病害,包括廣西在內(nèi)的我國(guó)大部分葡萄產(chǎn)區(qū)發(fā)病尤為嚴(yán)重,因此它也成為制約我國(guó)葡萄與葡萄酒產(chǎn)業(yè)發(fā)展的一大瓶頸。這一瓶頸終被打破。近日,廣西農(nóng)科院重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室葡萄分子設(shè)計(jì)育種團(tuán)隊(duì)依托廣西八桂學(xué)者亞熱帶作物分子育種崗位和重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室生物信息學(xué)平臺(tái),與中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)、北京理化測(cè)試中心、上海交通大學(xué)等單位合作,在國(guó)際上率先完成了葡萄霜霉菌全基因組遺傳密碼的破譯工作。

        廣西研究團(tuán)隊(duì)破解葡萄霜霉菌全基因組遺傳密碼

        該研究成果已在線發(fā)表在Nature出版集團(tuán)旗下的Scientific Reports雜志上。盧江教授為本論文的通訊作者,該團(tuán)隊(duì)成員尹玲、曲俊杰為共同第一作者,廣西農(nóng)科院重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室為第一完成單位。該團(tuán)隊(duì)成員依托重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室生物信息學(xué)平臺(tái),完成了從建庫(kù)策略的制定、數(shù)據(jù)預(yù)處理、全基因組組裝、重復(fù)序列注釋、基因結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和功能注釋?zhuān)街虏∠嚓P(guān)基因的挖掘分析、基因家族及比較基因組學(xué)分析、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及相關(guān)分析等全部的生物信息學(xué)分析工作。

        葡萄霜霉菌全基因組遺傳密碼的成功破譯,不僅為不同病原卵菌間的比較基因組學(xué)分析和進(jìn)化研究提供重要基礎(chǔ),同時(shí)將為研究葡萄霜霉菌與寄主間的互作機(jī)制、探索新的葡萄霜霉病防治手段和加速抗病育種進(jìn)程提供分子依據(jù)和理論基礎(chǔ),為葡萄霜霉病的綜合防控提供新的研究方向和策略。

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